Трепашкин подчеркивает, что именно в этом документе впервые излагает все известные ему детали по "делу Литвиненко". Он сообщил, что предупреждал Литвиненко об угрозе устранения еще до своего ареста в 2003 году. Ему стало известно о создании группы для физического устранения Литвиненко, Березовского, Фельштинского и их близкого окружения еще в 2002-2003 годах. В частности, в качестве доказательства он ссылается на полковника ФСБ Шебалина, служившего вместе с Литвиненко в сверхсекретном подразделении УРПО ФСБ и начавшего работать против Литвиненко. Тогда Шебалин просил Трепашкина узнать, "где проживает Литвиненко, где работает, где встречается со знакомыми", а также адреса и телефоны его родственников. В своем письме Трепакшин сообщил, что, по его мнению, ему " готовили ту роль, которую выполнили в 2006 году Луговой, Ковтун и Соколенко". Ссылаясь на слова Шебалина, он заявляет, что для устранения Литвиненко была создана специальная группа ФСБ. В нее входили как действующие, так и бывшие сотрудники спецслужб. Операция была рассчитана на то, что причину смерти от полония не установят.
Михаил Трепашкин 19 мая 2004 года был осужден Московским окружным военным судом на четыре года лишения свободы в колонии-поселении за разглашение гостайны. По версии обвинения, работая в КГБ и ФСБ, Трепашкин копировал служебные документы, которые в дальнейшем незаконно хранил у себя дома. После отбывания трети срока он подал в суд Нижнего Тагила заявление об условно-досрочном освобождении (УДО), однако ему в этом было отказано. На сегодня Трепашкин имеет пять действующих взысканий, объявленных ему за нарушение правил внутреннего распорядка. Ни одно из наложенных взысканий не было отменено прокуратурой. В связи с этим администрация колонии-поселения при ИК-13 направила в суд представление о переводе его в колонию общего режима. В суде находятся четыре жалобы адвокатов Трепашкина по поводу наложенных на него взысканий.
Также адвокаты и правозащитники просят суд назначить медкомиссию Трепашкину. Однако разрешения на это получить до сих пор не удалось. У бывшего офицера ФСБ тяжелая форма астмы.
Сторонники Трепашкина считают, что он наказан за предание гласности свидетельств в пользу причастности ФСБ к взрывам в московских многоэтажках осенью 1999 года. Трепашкин, более 20 лет проработавший в органах безопасности, стал широко известен благодаря своему участию в ноябре 1998 года в пресс-конференции, на которой бывший сотрудник ФСБ Александр Литвиненко и его коллеги утверждали, что по приказу руководства ФСБ они якобы участвовали в заговоре с целью убийства Бориса Березовского. После убийства Александра Литвиненко в Лондоне Трепашкин из тюрьмы хотел дать показания, возможно, проливающие свет на обстоятельства загадочной смерти бывшего коллеги. Однако власти запретили осужденному встречаться с британской полицией.